Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms