Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec3bP43025 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec3bP43025 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms