Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox7P40646 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox7P40646 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms