Protein–RNA interactions for Protein: P40237

Cd82, CD82 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd82P40237 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd82P40237 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd82P40237 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms