Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf2P39429 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms