Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin1P35438 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms