Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms