Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msr1P30204 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms