Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms