Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd9P28357 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms