Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjc1P28229 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms