Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms