Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZfaP23607 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZfaP23607 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms