Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsta3P23591 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms