Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gja1P23242 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms