Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb2P21619 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb2P21619 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb2P21619 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb2P21619 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmnb2P21619 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmnb2P21619 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms