Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms