Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VimP20152 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VimP20152 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VimP20152 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VimP20152 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VimP20152 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VimP20152 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms