Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms