Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P18526 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P18526 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18526 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18526 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P18526 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18526 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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