Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms