Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Becn2P0DM65 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Becn2P0DM65 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms