Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb1P09055 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms