Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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