Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtrP07309 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtrP07309 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtrP07309 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtrP07309 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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