Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms