Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms