Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04213 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04213 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04213 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04213 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04213 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04213 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04213 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms