Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01662 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01662 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01662 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01662 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01662 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms