Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01661 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01661 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01661 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01661 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01661 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01661 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms