Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo1O89026 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Robo1O89026 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms