Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms