Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cfdp1O88271 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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