Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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