Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja1O55176 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pja1O55176 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms