Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif6O55135 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif6O55135 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eif6O55135 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms