Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sap18O55128 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sap18O55128 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms