Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms