Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DffaO54786 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DffaO54786 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
DffaO54786 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DffaO54786 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms