Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Socs1O35716 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms