Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tnfrsf18O35714 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tnfrsf18O35714 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tnfrsf18O35714 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tnfrsf18O35714 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Tnfrsf18O35714 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf18O35714 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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