Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms