Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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