Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Slc18a3O35304 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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