Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms