Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22bO08547 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms