Protein–RNA interactions for Protein: M0QWJ9

Tmem178b, Transmembrane protein 178B, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmem178bM0QWJ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmem178bM0QWJ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmem178bM0QWJ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmem178bM0QWJ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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