Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3727J3QM54 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms