Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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