Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl3l2G3X992 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl3l2G3X992 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms